程研究室

公開資料

Press release

• 2020.1.20 Facebook Twitter
• 2019.12.9 Takahashi et al. Nucleic Acids Res. 2019 大学院理学系研究科HP、生物科学専攻HP
• 2019.11.2 Tian et al. RNA Biology 2019 大学院理学系研究科HP、日経バイオテク
• 2018.6.25 Takahashi et al. Nucleic Acids Res.2019 東大理学系・日経電子版

YouTube

• 2020.8.25 東大理学部YouTubeチャンネル・研究室の扉
• 2018.8.30 東大理学部YouTubeチャンネル・研究室の扉

Links

Websites

• siDirect 2.0 哺乳類細胞で効果が高く特異性の高いsiRNA設計ウェブサーバ- updated software for designing functional siRNA with reduced seed-dependent off-target effect.
• dsCheck 長いdsRNAのオフターゲット検証ウェブサーバ- highly sensitive off-target search software for double-stranded RNA-mediated RNA interference.
• siVirus ウイルスに効果的なsiRNA設計ウェブサーバ - web-based antiviral siRNA design software for highly divergent viral sequences.
• CRISPRdirect CRISPR/Cas9システムにおけるguide RNA設計ウェブサーバー CRISPRdirect: software for designing CRISPR/Cas guide RNA with reduced off-target sites.

材料・データ等登録先

• Addgene（各種プラスミド）
• ADAR sequence data (Ishiguro, Galipon, Ishii et al. RNA Biology 2018). DRA007319
  ADAR1-p110 IP: SAMD00022956, DRR150095
  ADAR1-p110 INPUT: SAMD00022957, DRR150096
  ADAR2 IP: SAMD00022958, DRR150097
  ADAR2 INPUT: SAMD00022959, DRR150098
  GFP INPUT: SAMD00022960, DRR150099
  metadata: DRA007319
• LGP2 microarray data (Takahashi et al. NAR 2018) GSE113028
• TRBP RNA sequence data (Takahashi et al. NAR 2018) DRA006762
• Drosophila Genomics Resource Center (ショウジョウバエ成虫原基および中枢神経系由来細胞株）

学会

• 日本分子生物学会
• 日本核酸医薬学会
• 日本RNA学会

東京大学産学連携プロポーザル

• RNAサイレンシングによる効率的な遺伝子ノックダウン法の利用

データベース

• NCBI
• UCSC
• miRBase