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    E-cadherin is transcriptionally activated via suppression of ZEB1 transcriptional repressor by small RNA-mediated gene silencing.
    PLoS ONE. 6, e28688.[PDF]
  • Yamato K, Egawa K, Endo S, Ui-Tei K, Yamada T, Saigo K, Hyodo I, Kiyano T, Nakagawa I. (2011)
    Enhanced specificity of HPV16 E6E7 siRNA by RNA-DNA chimera modification.
    Cancer Gene Ther. 18, 587-597.[PDF]
  • Naito Y, Ui-Tei K. (2011)
    Designing functional siRNA with reduced off-target effects.
    Methods Mol. Biol. In press.
  • Sasaki N, Shinomi M, Hirano K, Ui-Tei K, Nishihara S. (2011)
    Lacdinac (Galnacβ1-4glcnac) Contributes to Self-Renewal of Mouse Embryonic Stem Cells by Regulating LIF/STAT3 Signaling.
    Stem Cells. 29, 641-650.[PDF]

2010

  • Tanaka F, Mochizuki T, Liang X, Asanuma H, Tanaka S, Suzuki K, Kitamura SI, Nishikawa A, Ui-Tei K, Hagiya M. (2010)
    Robust and Photocontrollable DNA Capsules Using Azobenzenes.
    Nano Lett. 10, 3560-3565.[PDF]
  • Takizawa T, Gemma A, Ui-Tei K, Aizawa Y, Sadovsky Y, Robinson JM, Seike M, Miyake K. (2010)
    Basic and clinical studies on functional RNA molecules for advanced medical technologies.
    J. Nippon Med. Sch. 77, 71-79. [PDF]
  • Taniue K, Nishida A, Hamada F, Sugie A, Oda T, Ui-Tei K, Tabata T, Akiyama T. (2010)
    Sunspot, a link between Wingless signaling and endoreplication in Drosophila.
    Development 137, 1755-1764.[PubMed]
  • Hamada T, Teraoka M, Imaki J, Ui-Tei K, Ladherc R.K, Asahara T. (2010)
    Gene expression of Spag6 in chick central nervous system.
    Anat. Histol. Embryol. 39, 227-32. [PDF]
  • Narikawa K, Nishi K, Naito Y, Mazda M, Ui-Tei K. (2010)
    Genome-wide identification and analysis of miRNAs complementary to upstream of mRNA transcription start sites.
    Gene Silencing: Theory Techniques and Applications, Nova Science Publishers,287-319. [PDF]

2009

  • Naito Y, Yoshimura J, Morishita S, Ui-Tei K. (2009)
    siDirect 2.0: updated software for designing functional siRNA with reduced seed-dependent off-target effect.
    BMC Bioinformatics 10, 392. [PDF]
  • Ui-Tei K, Nishi K, Naito Y, Zenno S, Juni A, Saigo K. (2009)
    Reduced base-base interactions between the DNA seed and RNA target are the major determinants of a significant reduction in the off-target effect due to DNA-seed-containing siRNA.
    Proceedings of the 2009 Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS2009), 298-304. [PDF]
  • Naito Y, Nishi K, Juni A, Ui-Tei K. (2009)
    Functional shRNA expression system with reduced off-target effects.
    Proceedings of the 2009 Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS2009), 291-297. [PDF]
  • Naito Y, Saigo K, Ui-Tei K. (2009)
    Experimental validation of published siRNA design algorithms.
    Small Interfering RNA: New Research, 185-194.
  • Ui-Tei K, Naito Y, Zenno S, Nishi K, Juni A, Tanaka A, Saigo K. (2009)
    Bipartite roles of the central region of the siRNA guide strand in RNA interference due to modified siRNA with a DNA seed arm.
    Research Advances in Nucleic Acids Research, 3, 1-17.

2008

  • Ui-Tei K, Naito Y, Nishi K, Juni A, Saigo K. (2008)
    Thermodynamic stability and Watson-Crick base pairing in the seed duplex are major determinants of the efficiency of the siRNA-based off-target effect.
    Nucleic Acids Res. 36, 7100-7109. [PDF]
  • Ui-Tei K, Zenno S, Naito Y, Takahashi F, Nishi K, Juni A, Tanaka A, Saigo K. (2008)
    DNA-modified siRNA-dependent gene silencing with reduced off-target effect is induced through a pathway parallel to that for siRNA-mediated RNA interference.
    Proceedings of the 2008 Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS2008), 339-345. [PDF]
  • Piao Z-F, Takahashi F, Saigo K, Ui-Tei K. (2008)
    RNAi microarray by reverse transfection of siRNA and shRNA for functional genomics.
    Proceedings of the 2008 Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS2008), 346-351. [PDF]
  • Naito Y, Saigo K, Ui-Tei K. (2008)
    Evaluation of published rational siRNA design algorithms using firefly luciferase gene as a reporter.
    RNA interference research progress, 3-11. [PDF]
  • Okamoto M, Tomonari S, Naito Y, Saigo K, Noji S, Ui-Tei K, Ohuchi H. (2008)
    Introduction of silencing-inducing transgene against Fgf19 does not affect expression of Tbx5 and β3-tubulin in the developing chicken retina.
    Dev. Growth Differ. 50, 159-168. [PubMed]
  • Ui-Tei K, Naito Y, Zenno S, Nishi K, Yamato K, Takahashi F, Juni A, Saigo K. (2008)
    Functional dissection of siRNA sequence by systematic DNA substitution: modified siRNA with a DNA seed arm is a powerful tool for mammalian gene silencing with significantly reduced off-target effect.
    Nucleic Acids Res. 36, 2136-2151. [PDF]
  • Yamato K, Yamada T, Kizaki M, Ui-Tei K, Natori Y, Fujino M, Nishihara T, Ikeda Y, Nasu Y, Saigo K, Yoshinouchi M. (2008)
    New highly potent and specific E6 and E7 siRNAs for treatment of HPV16 positive cervical cancer.
    Cancer Gene Ther. 15, 140-153. [PDF]
  • Sasaki N, Okishio K, Ui-Tei K, Saigo K, Kinoshita-Toyoda A, Toyoda H, Nishimura T, Suda Y, Hayasaka M, Hanaoka K, Hitoshi S, Ikenaka K, Nishihara S. (2008)
    Heparan sulfate regulates self-renewal and pluripotency of embryonic stem cells.
    J. Biol. Chem. 283, 3594-3606. [PDF]

2007

  • Nishi K, Saigo K. (2007)
    Cellular internalization of green fluorescence protein fused with herpes simplex virus protein VP22 via a lipid-raft-mediated endocytic pathway independent of caveolae and Rho family GTPases but dependent on dynamin and Arf6.
    J. Biol. Chem. 282, 27503-27517. [PDF]
  • Nishimura I, Ui-Tei K, Saigo K, Ishii H, Sakuma Y, Kato M. (2007)
    17β-estradiol at physiological concentrations augments Ca2+-activated K+ currents via estrogen receptor β in the GnRH neuronal cell line GT1-7.
    Endocrinology 149, 774-782. [PDF]
  • Ui-Tei K, Zenno S, Saigo K. (2007)
    Sequence requirements for effective mammalian RNAi induced by short double-stranded RNAs equal to or more than 22bp in length.
    Antisense Elements (Genetics) Research Focus, 141-160.[PDF]
  • Naito Y, Nohtomi K, Onogi T, Uenishi R, Ui-Tei K, Saigo K, Takebe Y. (2007)
    Optimal design and validation of antiviral siRNA for targeting HIV-1.
    Retrovirology 6, 80.[PDF]
  • Kojima S, Matsumoto K, Hirose M, Shimada M, Nagano M, Shigeyoshi Y, Hoshino SI, Ui-Tei K, Saigo K, Green CB, Sakaki Y, Tei H. (2007)
    LARK activates posttranscriptional expression of an essential mammalian clock protein, PERIOD1.
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104, 1859-1864. [PDF]
  • Ui-Tei K, Naito Y, Saigo K. (2007)
    Guidelines for the selection of effective short-interfering RNA sequences for functional genomics.
    Methods Mol. Biol. 361, 201-216. [PubMed]

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  • Ui-Tei K, Naito Y, Saigo K. (2006)
    Essential notes regarding the design of functional siRNAs for efficient mammalian RNAi.
    J. Biomed. Biotechnol. 2006, 65052. [PDF]
  • siVirus web server at http://siVirus.RNAi.jp/
    Naito Y, Ui-Tei K, Nishikawa T, Takebe Y, Saigo K. (2006)
    siVirus: web-based antiviral siRNA design software for highly divergent viral sequences.
    Nucleic Acids Res. 34, W448-W450. [PDF]
  • Kamiyama S, Sasaki N, Goda E, Ui-Tei K, Saigo K, Narimatsu H, Jigami Y, Kannagi R, Irimura T, Nishihara S. (2006)
    Molecular cloning and characterization of a novel 3′-phosphoadenosine 5′-phosphosulfate transporter, PAPST2.
    J. Biol. Chem. 281, 10945-10953. [PDF]

2005

  • Ui-Tei K, Zenno S, Juni A, Saigo K. (2005)
    RNAi induced in mammalian and Drosophila cells via transfection of dimers and trimers of short interfering RNA.
    J. RNAi Gene Silencing 1, 79-87. [PDF]
  • dsCheck web server at http://dsCheck.RNAi.jp/
    Naito Y, Yamada T, Matsumiya T, Ui-Tei K, Saigo K, Morishita S. (2005)
    dsCheck: highly sensitive off-target search software for double-stranded RNA-mediated RNA interference.
    Nucleic Acids Res. 33, W589-W591. [PDF]
  • Takahashi M, Takahashi F, Ui-Tei K, Kojima T, Saigo K. (2005)
    Requirements of genetic interactions between Src42A, armadillo and shotgun, a gene encoding E-cadherin, for normal development in Drosophila.
    Development 132, 2547-2559.[PDF]
  • Niimura M, Isoo N, Takasugi N, Tsuruoka M, Ui-Tei K, Saigo K, Morohashi Y, Tomita T, Iwatsubo T. (2005)
    Aph-1 contributes to the stabilization and trafficking of the gamma-secretase complex through mechanisms involving intermolecular and intramolecular interactions.
    J. Biol. Chem. 280, 12967-12975. [PDF]

2004

  • Takagi Y, Nomizu M, Ui-Tei K, Tokushige N, Hirohashi S. (2004)
    Active sites in the carboxyl-terminal region of the laminin alpha chain in Drosophila neuronal cell spreading.
    Arch. Insect. Biochem. Physiol. 56, 162-169. [PubMed]
  • siDirect web server at http://design.RNAi.jp/
    Naito Y, Yamada T, Ui-Tei K, Morishita S, Saigo K. (2004)
    siDirect: highly effective, target-specific siRNA design software for mammalian RNA interference.
    Nucleic Acids Res. 32, W124-W129. [PDF]
  • Ui-Tei K, Ueda R, Zenno S, Takahashi F, Doi N, Naito Y, Yamamoto M, Hashimoto N, Takahashi K, Hamada T, Tokunaga T, Saigo K. (2004)
    RNA-interference, induced by transient and continuous expression of hairpin RNA in cells from Drosophila and mammals.
    Mol. Biol. 38, 276-287. [PubMed]
  • Ui-Tei K, Naito Y, Takahashi F, Haraguchi T, Ohki-Hamazaki H, Juni A, Ueda R, Saigo K. (2004)
    Guidelines for the selection of highly effective siRNA sequences for mammalian and chick RNA interference.
    Nucleic Acids Res. 32, 936-948. [PDF]
  • Mishima T, Hamada T, Ui-Tei K, Takahashi F, Miyata Y, Imaki J, Suzuki H, Yamashita K. (2004)
    Expression of DDAH1 in chick and rat embryos.
    Dev. Brain Res. 148, 223-232. [PDF]

2003

  • Kato M, Ui-Tei K, Watanabe M, Sakuma Y. (2003)
    Characterization of voltage-gated calcium currents in gonadotropin-releasing hormone neurons tagged with green fluorescent protein in rats.
    Endocrinology 144, 5118-5125. [PDF]
  • Iwabuchi M, Ui-Tei K, Yamada K, Matsuda Y, Sakai Y, Tanaka K, Ohki-Hamazaki H. (2003)
    Molecular cloning and characterization of avian bombesin-like peptide receptors: new tools for investigating molecular basis for ligand selectivity.
    Br. J. Pharmacol. 139, 555-566. [PDF]
  • Doi N, Zenno S, Ueda R, Ohki-Hamazaki H, Ui-Tei K, Saigo K. (2003)
    Short-interfering-RNA-mediated gene silencing in mammalian cells requires Dicer and eIF2C translation initiation factors.
    Curr. Biol. 13, 41-46. [PDF]

2002

  • Hamada T, Ui-Tei K, Imaki J, Takahashi F, Onodera H, Mishima T, Miyata Y. (2002)
    The expression of SCDGF/PDGF-C/fallotein and SCDGF-B/PDGF-D in the rat central nervous system.
    Mech. Dev. 112, 161-164. [PDF]
  • Seike M, Gemma A, Hosoya Y, Hosomi Y, Okano T, Kurimoto F, Uematsu K, Tekenaka K, Yoshimura A, Shibuya M, Ui-Tei K, Kudoh S. (2002)
    The pomoter region of the human BUBR1 gene and its expression analysis in lung cancer.
    Lung Cancer 38, 229-234. [PDF]
  • Uwo MF, Ui-Tei K, Park P, Takeda M. (2002)
    Replacement of midgut epithelium in the greater wax moth, Galleria mellonela, during larval-pupal moult.
    Cell Tissue Res. 308, 319-331. [PDF]

2001

  • Piao ZF, Ui-Tei K, Nagano M, Miyata Y. (2001)
    Participation of Intracellular Ca2+/calmodulin and Protein Kinase(s) in the Pathway of Apoptosis Induced by a Drosophila Cell Death Gene, reaper.
    Mol. Cell. Biol. Res. Commun. 4, 307-312. [PDF]
  • Hamada T, Ui-Tei K, Imaki J, Miyata Y. (2001)
    Molecular Cloning of SCDGF-B, a Novel Growth Factor Homologous to SCDGF/PDGF-C/fallotein.
    Biochem. Biophys. Res. Commun. 280, 733-737. [PDF]

2000

  • Ui-Tei K, Zenno S, Miyata Y, Saigo K. (2000)
    Sensitive assay of RNA interference in Drosophila and chinese hamster cultured cells using firefly luciferase gene as target.
    FEBS Lett. 479, 79-82. [PDF]
  • Ui-Tei K, Nagano M, Miyata Y. (2000)
    Calmodulin-dependent and -independent apoptosis in cells of a Drosophila neuronal cell line.
    Apoptosis 5, 133-140. [PDF]
  • Nagano M, Ui-Tei K, Suzuki H, Piao Z, Miyata Y. (2000)
    CDK inhibitors suppress apoptosis induced by chemicals and by excessive expression of a cell death gene, reaper, in Drosophila cell.
    Apoptosis 5, 543-550. [PDF]
  • Usui-Aoki K, Ito, H, Ui-Tei K, Takahashi K, Lukacsovich T, Awano W, Nakata H, Piao ZF, Nilsson EE, Tomida J, Yamamoto D.(2000)
    Formation of the male-specific muscle in female Drosophila by ectopic fruitless expression.
    Nat. Cell Biol. 2, 500-506. [PDF]
  • Hamada T, Ui-Tei K, Miyata Y. (2000)
    A novel gene derived from developing spinal cords, SCDGF, is a unique member of the PDGF/VEGF family.
    FEBS Lett. 475, 97-102. [PDF]
  • Takagi Y, Ui-Tei K, Hirohashi Y. (2000)
    Adhesion-dependent tyrosine phosphorylation of Enabled in Drosophila neuronal cell line.
    Biochem. Biophys. Res. Commun. 270, 482-487. [PDF]
  • Ui-Tei K, Miyata Y.(2000)
    Cell lines derived from Drosophila larval central nervous system and their practical applications.
    Drosophila Information Service 83, 188-189. [PDF]

 

和文総説

2010

  • 内藤 雄樹、山田 智之、程 久美子、森下 真一、西郷 薫 (2010)
    「効率的なsiRNAの設計」
    RNA工学の基礎と応用(普及版) 104-113. シーエムシー出版.
  • 内藤 雄樹、程 久美子 (2010)
    「培養細胞での遺伝子ノックダウン法 哺乳類細胞での標的遺伝子を特異的にノックダウンできるsiRNAの選択法」
    改訂第5版 新 遺伝子工学ハンドブック, 209-214, 羊土社.
  • 西 賢二、程 久美子 (2010)
    「培養細胞での遺伝子ノックダウン法 siRNAおよびmiRNAによる遺伝子ノックダウン」
    改訂第5版 新 遺伝子工学ハンドブック, 215-220, 羊土社.

2009

  • 程 久美子 (2009)
    「RNA干渉」
    東大式 現代用語ナビ 94-95, 化学同人. [Link]

2008

  • 内藤 雄樹、程 久美子 (2008)
    「RNA干渉実験のためのウェブツール」
    実験医学(増刊)バイオデータベースとソフトウェア最前線, 104-111, 羊土社. [Link]
  • 西 賢二、程 久美子 (2008)
    「shRNAライブラリーを用いた特定分子経路の網羅的解析法」
    RNA実験ノート 下巻, 小分子RNAの解析からRNAiへの応用まで, 93-98, 羊土社. [Link]
  • 内藤 雄樹、西 賢二、善野 修平、西郷 薫、程 久美子 (2008)
    「RNAiによる遺伝子発現抑制効果の評価」
    原理からよくわかるリアルタイムPCR実験ガイド、85-95, 羊土社. [Link]

2007

  • 杉本 亜砂子、程 久美子 (2007)
    「RNA干渉:二本鎖RNAによる新しい遺伝子発現抑制機構の発見」
    科学, 77, 13-15.

2006

  • 程 久美子、 北條 浩彦 編集 (2006)
    「RNAi実験なるほどQ&A」2006年10月1日, 羊土社.
  • 程 久美子 企画 (2006)
    「これで上手くいく!RNAi実験のTips」
    バイオテクノロジージャーナル 2006年1-2月号, 羊土社.
  • 程 久美子、西郷 薫 (2006)
    「遺伝子発現操作ー細胞ー」
    遺伝子工学集中マスター [編集:山本 雅、仙波 健太郎] p.65-73. 2006年12月20日, 羊土社.
  • 程 久美子、西郷 薫 (2006)
    「培養細胞へのトランスフェクションによるRNAi」
    バイオテクノロジージャーナル 6, 29-33.
  • 程 久美子 (2006)
    「ポストゲノムシークエンス時代の遺伝子機能解析法-RNAi」
    バイオテクノロジージャーナル 8, 20-22.
  • 内藤 雄樹、山田 智之、程 久美子、森下 真一、西郷 薫 (2006)
    「siRNA選択法 -配列を選択するか、効けば良いか」
    バイオテクノロジージャーナル 6, 23-28.

2005

  • 程 久美子、西郷 薫 (2005)
    「RNAiの原理と有効なsiRNA設計法」
    実験医学 23, 559-563.
  • 山田 智之、内藤 雄樹、程 久美子、森下 真一、西郷 薫 (2005)
    「効果的なsiRNAを設計するには?」
    生化学 77, 519-1525.
  • 内藤 雄樹、山田 智之、程 久美子、森下 真一、西郷 薫 (2005)
    「効率的なsiRNAの設計」
    RNA工学の最前線 104-113. シーエムシー出版.

2004

  • 程 久美子、 西郷 薫 (2004)
    「II. ゲノムネットワークリソースの整備 7. RNAiのメカニズムとsiRNA配列設計法」
    蛋白質核酸酵素 増刊号「ゲノムネットワーク」48, 2662-2670.
  • 程 久美子、西郷 薫 (2004)
    「RNAiのメカニズムとsiRNA配列設計法」
    蛋白質核酸酵素(増刊号)49, 2662-2670, 共立出版.
  • 程 久美子 (2004)
    「膨大な遺伝子情報から機能を探る手法」
    東京大学 バイオインフォマテイクス集中講義 78-83. [編集:高木 利久] 2004年6月10日, 羊土社.
  • 程 久美子、西郷 薫 (2004)
    「哺乳動物におけるRNA interferenceの分子メカニズム」
    医学のあゆみ 208, 649-652.
  • 程 久美子、西郷 薫 (2004)
    「新しい遺伝子ノックダウン法RNAi-有効なsiRNAの配列選択法」
    Bioベンチャー 4, 41-44.
  • 程 久美子、内藤 雄樹、西郷 薫 (2004)
    「RNAi」
    先端の分析法 ~理工学からナノ・バイオまで~, 254-256, エヌ・ティー・エス.

2003

  • 程 久美子、善野 修平、高橋 邦明、上田 龍、西郷 薫 (2003)
    「RNAi法による逆遺伝学」
    ポストシークエンス タンパク質実験法4 構造・機能解析の実際、47-61. 東京化学同人.
  • 程 久美子、善野 修平、西郷 薫 (2003)
    「培養細胞でのsiRNAによるRNAi法」
    実験医学別冊 新訂 新遺伝子工学ハンドブック、243-246. 羊土社.
  • 土井 昇、善野 修平、程 久美子、西郷 薫 (2003)
    「siRNAによるRNAiの機構」
    遺伝子工学、7, 26(322)-31(327).

2002

  • 程 久美子、善野 修平、西郷 薫 (2002)
    「哺乳類培養細胞でのsiRNAによるRNAiプロトコル」
    細胞工学、21, 1057-1061. 秀潤社.
  • 高橋 史峰、浜田 剛、程 久美子(2002)
    「運動ニューロン生存活性を示す7SL RNAの同定と分布」
    最新医学、25, 1682-1686, 最新医学社.

2001

  • 程 久美子、善野 修平、宮田 雄平、西郷 薫 (2001)
    「RNA interferenceによる新しい遺伝子機能破壊法」
    Clinical Neuroscience、19, 744-745. 中外医学社.

 

学会発表等(2007~)

2011

  • 西 賢二、西 愛、程 久美子
    「核内RNAサイレンシングはヒトTNRC6A/GW182によるArgonauteの核内移行により引き起こされる」
    第34回日本分子生物学会年会(2011.12) パシフィコ横浜
  • Tomoko Takahashi, Kenji Nishi, Shuhei Zenno and Kumiko Ui-Tei
    "Comparative analysis of siRNA binding patterns of dsRNA binding proteins, TRBP and PACT"
    第34回日本分子生物学会年会(2011.12) パシフィコ横浜
  • 日比生 直樹、長田 喜郎、西 賢二、程 久美子
    「miRNAによるサイレンシング効率を決定する要因の同定」
    第34回日本分子生物学会年会(2011.12) パシフィコ横浜
  • 石井 倫太郎、西 賢二、程 久美子
    「2本鎖RNA特異的アデノシンデアミネースと相互作用するmiRNAの同定」
    第34回日本分子生物学会年会(2011.12) パシフィコ横浜
  • 長沢 達矢、程 久美子
    「RNAサイレンシング関連分子のヒトshRNAライブラリを用いたスクリーニング」
    第34回日本分子生物学会年会(2011.12) パシフィコ横浜
  • 清水 英悟、日比生 直樹、長田 喜郎、程 久美子
    「外来性miRNAのトランスフェクションによる内在性miRNAサイレンシング効果抑制のマイクロアレイ解析」
    第34回日本分子生物学会年会(2011.12) パシフィコ横浜
  • 程 久美子
    「小分子RNA作用マシナリーの調節機構 -ヒトTNRC6AによるAGOタンパク質の核内へのナビゲーションとその機能」
    新学術領域 非コードRNA作用マシナリー 第3回領域会議 (2011.11) 東京大学・武田先端知ビル
  • 西 賢二、西 愛、程 久美子
    "Human TNRC6A is a nuclear-cytoplasmic shuttling protein which navigates Argonaute into the nucleus"
    新学術領域 非コードRNA作用マシナリー 第3回領域会議 (2011.11) 東京大学・武田先端知ビル
  • 日比生 直樹、長田 喜郎、西 賢二、程 久美子
    「MicroRNAサイレンシング効率の情報科学的解析」
    新学術領域 非コードRNA作用マシナリー 第3回領域会議 (2011.11) 東京大学・武田先端知ビル
  • Tomoko Takahashi, Kenji Nishi, Shuhei Zenno and Kumiko Ui-Tei
    “Identification of small interfering RNA binding domains of the TAR RNA binding protein (TRBP) and their molecular implication in RNA interference”
    Sixteenth Annual Meeting of the RNA Society (2011.6.14-18) Kyoto, Japan
  • 程 久美子
    「高感度アレイを利用した小分子 RNA の作用機序の解明」
    2011 アジレント ゲノミクスフォーラム (2011.6.14) 東京
  • 日比生 直樹、長田 喜郎、西 賢二、程 久美子
    「microRNAサイレンシング活性の定量的解析」
    第11回 東京大学生命科学シンポジウム LSM SYMPOSIUM 2011 (2011.6) 東京大学・工学部2号館

2010

  • 西 賢二、田中 愛、程 久美子
    「ヒトGW182タンパク質の核―細胞質間輸送機構の解析」
    BMB2010 (2010.12) 神戸ポートアイランド
  • 高橋 朋子、西 賢二、善野 修平、程 久美子
    「siRNA非シード部位と二本鎖RNA結合タンパク質TRBPの相互作用」
    BMB2010 (2010.12) 神戸ポートアイランド
  • 日比生 直樹、長田 喜郎、内藤 雄樹、西 賢二、程 久美子
    「miRNAサイレンシング活性を決める要因の検討」
    BMB2010 (2010.12) 神戸ポートアイランド
  • 程 久美子
    「小分子RNA作用マシナリーの調節機構ー内在性miRNAサイレンシングの外来性miRNAによる抑制とその定量化」
    新学術領域 非コードRNA作用マシナリー 第2回領域会議 (2010.10) 岡崎カンファレンスセンター
  • 高橋 朋子、西 賢二、善野 修平、程 久美子
    「2本鎖RNA結合タンパク質TRBPとsiRNA相互作用の解析」
    新学術領域 非コードRNA作用マシナリー 第2回領域会議 (2010.10) 岡崎カンファレンスセンター
  • 内藤 雄樹、程 久美子
    「高いゲノム多様性をもつHIV-1を標的とする至適siRNAの設計」
    第20回日本数理生物学会年会(2010.9.16) 北海道大学学術交流会館
  • Kenji Nishi, Ai Tanaka, Kumiko Ui-Tei
    “Identification of Nuclear Export Signal and Nuclear Localization Signal in Human GW182 Family Proteins”
    The 19th CDB Meeting "RNA Sciences in Cell and Developmental Biology"(2010.5.10-12)RIKEN Center for Developmental Biology, Kobe, Japan
  • Yuki Naito, Jun Yoshimura, Shinichi Morishita, Kumiko Ui-Tei
    “siDirect 2.0: an Updated Website to Select Functional, Target-specific siRNA with Reduced Seed-dependent Off-target Effect for Mammalian Functional Genomics”
    The 19th CDB Meeting "RNA Sciences in Cell and Developmental Biology"(2010.5.10-12)RIKEN Center for Developmental Biology, Kobe, Japan
  • 西 賢二、田中 愛、程 久美子
    「ヒトGW182タンパク質における核外移行シグナル及び核移行シグナルの同定」
    第10回 東京大学生命科学シンポジウム Todai BIO 2010(2010.5.1) 東京大学・安田講堂/工学部2号館
  • 内藤 雄樹、吉村 淳、森下 真一、程 久美子
    「siRNAのseed配列によるオフターゲット効果を最少とし、標的mRNA特異的抑制効果を示すsiRNA設計ウェブサーバの構築」
    第10回 東京大学生命科学シンポジウム Todai BIO 2010(2010.5.1) 東京大学・安田講堂/工学部2号館
  • Kumiko Ui-Tei
    “Modified siRNA is a powerful tool for mammalian gene silencing with significantly reduced off-target effect”
    The 3rd Pan Pacific Symposium on Stem Cells Research 2010 (PPSSC 2010)(2010.4.17)Taichung, Taiwan

2009

  • 程 久美子
    「siRNAの塩基配列に依存したサイレンシング活性」
    防衛医科大学「バイオを論じる会」(2010.2)
  • 程 久美子
    「RNAサイレンシング活性を制御する小分子RNAの塩基配列」
    第32回日本分子生物学会年会(2009.12) ワークショップ 「イントロン進化の最前線」 パシフィコ横浜
  • 内藤 雄樹、吉村 淳、森下 真一、程 久美子
    “siDrect2.0:a website updated to select functional siRNA with reduced off-target effect for functional genomics”
    第32回日本分子生物学会年会(2009.12) パシフィコ横浜
  • 西 賢二、田中 愛、程 久美子
    “Motif analyses of subcellular location of human GW182 family proteins”
    第32回日本分子生物学会年会(2009.12) パシフィコ横浜
  • 松田 みなみ、西 賢二、程 久美子
    「転写因子ZEB1の制御を介したE-カドヘリンの発現誘導に関わる小分子RNA」
    第32回日本分子生物学会年会(2009.12) パシフィコ横浜
  • 米沢 聡史、西 賢二、内藤 雄樹、程 久美子
    「イントロン性microRNAの宿主遺伝子に対する発現制御機構の解析」
    第32回日本分子生物学会年会(2009.12) パシフィコ横浜
  • 高橋 朋子、西 賢二、善野 修平、程 久美子
    「siRNA非シード部位とRNA結合タンパク質の相互作用」
    第32回日本分子生物学会年会(2009.12) パシフィコ横浜
  • 長田 喜郎、西 賢二、内藤 雄樹、程 久美子
    「Small RNAシード領域の熱力学的安定性に依存したサイレンシング効果」
    第32回日本分子生物学会年会(2009.12) パシフィコ横浜
  • Taniue K, Nishida A, Hamada F, Ui-Tei K, Tabata T, Oda T, Akiyama T.
    “Sunspot, a link between Wingless signaling and endoreplication in Drosophila.
    第32回日本分子生物学会年会(2009.12) パシフィコ横浜
  • 程 久美子
    「RNAiによる特異的遺伝子発現抑制システム」
    法政大学セミナー(2009.11)
  • Ui-Tei K, Nishi K, Naito Y, Zenno S, Juni A, Saigo, K.
    “Reduced base-base interactions between the DNA seed and RNA target are the major determinants of a significant reduction in the off-target effect due to DNA-seed-containing siRNA”
    2009 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science(MHS2009) (2009.11) Toyoda Auditorium, Nagoya University.
  • Naito Y, Nishi K, Juni A, Ui-Tei K.
    “Functional shRNA expression system with reduced off-target effects”
    2009 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science(MHS2009) (2009.11) Toyoda Auditorium, Nagoya University.
  • 程 久美子
    「小分子RNAによる標的mRNA認識機構」
    私立大学戦略的研究基盤形成支援事業シンポジウム「診断・治療に新たな展開をもたらす機能性RNA研究」(2009.11) 日本医科大学・橘桜会館
  • 程 久美子
    「小分子RNA作用マシナリーの調節機構ー塩基配列に依存した小分子RNAによるサイレンシング活性の調節」
    新学術領域 非コードRNA作用マシナリー 第1回領域会議 (2009.10) 東京大学・工学部11号館
  • 程 久美子
    「1遺伝子特異的発現抑制システムの構築」
    マルチスケール操作によるシステム細胞工学(バイオ操作)公開シンポジウム=分野横断的手法を活用した新時代の生命科学研究= (2009.8) 東京大学・山上会館

2008

  • 程 久美子、内藤 雄樹、善野 修平、西 賢二、従二 綾、田中 愛、西郷 薫
    「siRNAの中央部分は標的mRNAの二次的認識部位として機能する」
    マルチスケール操作によるシステム細胞工学(バイオ操作)(2009.3) 東京エレクトロンホール宮城
  • 程 久美子、内藤 雄樹、善野 修平、西 賢二、大和 建嗣、従二 綾、田中 愛、西郷 薫
    「部分的DNA置換によるsiRNA配列の領域特異的機能解析:シード領域をDNAに置換したsiRNAはoff-target効果がない」
    第31回日本分子生物学会年会(2008.12) 神戸ポートアイランド
  • 松田 みなみ、西 賢二、内藤 雄樹、程 久美子
    「E-カドヘリンのRNA activationは転写因子に対するオフターゲット効果によって引き起こされるのか?」
    第31回日本分子生物学会年会(2008.12) 神戸ポートアイランド
  • 米沢 諭史、内藤 雄樹、西 賢二、程 久美子
    「オートフィードバック制御が可能なイントロン性microRNAの検索とその作用」
    第31回日本分子生物学会年会(2008.12) 神戸ポートアイランド
  • 佐々木 紀彦、沖塩 和彦、平野 拓也、程 久美子、豊田 英尚、西村 知晃、墨田 泰生、早坂 美知子、花岡 和則、等 誠司、池中 一裕、西原 祥子
    「へパラン硫酸はマウス胚性幹細胞の未分化性と多能性を制御する」
    第31回日本分子生物学会年会(2008.12) 神戸ポートアイランド
  • Ui-Tei K, Zenno S, Naito Y, Takahashi F, Nishi K, Juni A, Tanaka A, Saigo, K.
    “DNA-modified siRNA-dependent gene silencing responsible for reducing off-target”
    2008 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science(MHS2008) (2008.11) Nagoya University.
  • Piao Z.F, Takahashi F, Saigo K, Ui-Tei K.
    “RNAi cell microarray by reverse transfection of siRNA and shRNA vector for functional genomics”
    2008 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science(MHS2008)(2008.11) Nagoya University.
  • 程 久美子、内藤 雄樹、善野 修平、西 賢二、従二 綾、田中 愛、西郷 薫
    「siRNA配列の領域特異的機能解析によるoff-target効果の少ないsiRNA設計」
    東京大学生命科学ネットワークシンポジウム(2008.9) 東京大学・安田講堂/工学部2号館
  • 内藤 雄樹、納冨 香子、小野木 利成、西郷 薫、武部 豊、程 久美子
    「ヒト細胞で効率よく標的遺伝子を抑制できるsiRNA配列設計法のHIV-1への応用」
    東京大学生命科学ネットワークシンポジウム(2008.9) 東京大学・安田講堂/工学部2号館
  • 程 久美子
    「塩基配列の相補性に依存した低分子RNAによる標的遺伝子抑制機構」
    慶応大学 セミナー(2008.5.20) 慶應大学 鶴岡タウンキャンパス
  • 程 久美子
    「RNAiとは何か 〜基礎から応用まで〜」
    三菱科学総合研究所 セミナー(2008.4.16) 三菱科学総合研究所

2007

    • 内藤 雄樹、納冨 香子、小野木 利成、程 久美子、西郷 薫、武部 豊
      「高いゲノム多様性をもつウイルスに効果的なsiRNAの設計」
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会(2007.12) パシフィコ横浜、ヨコハマグランドインターコンチネンタルホテル
    • 西 賢二、程 久美子、西郷 薫
      「単純ヘルペス1型VP22タンパク質の細胞への取り込み機構」
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会(2007.12) パシフィコ横浜、ヨコハマグランドインターコンチネンタルホテル
    • 程 久美子、内藤 雄樹、善野 修平、高橋 史峰、西 賢二、従二 綾、田中 愛、西郷 薫
      「哺乳類RNAiにおけるsiRNAガイド鎖5'末端領域の役割とoff-target効果が弱いsiDRC設計」
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会(2007.12) パシフィコ横浜、ヨコハマグランドインターコンチネンタルホテル
    • 加藤 稔、黄 怡瑩、松尾 美奈、高科 庸子、佐々木 一代、従二 綾、程 久美子、坂井 薫、石井 健久、上條 信一、西郷 薫、程 肇
      「miR187配列を利用したMC4R RNAi トランスジェニックマウスの作成と解析」
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会(2007.12) パシフィコ横浜、ヨコハマグランドインターコンチネンタルホテル
    • 程 久美子
      「RNAi実験の基本手法詳説講座〜RNAi実験のテクニックを理解する7つのステップ〜」
      学際企画 東京:科学技術館(2007.11.11) 大阪:大阪科学技術センター(2007.11.12)
    • 程 久美子
      「バイオインフォマテイクスを用いたRNA研究による生命現象の理解」
      お茶の水女子大学 女性リーダー育成プログラム「生命情報学を使いこなせる女性人材の育成」第9回バイオインフォマテイクスへの招待(2007.10) お茶の水女子大学
    • 程 久美子
      「哺乳類細胞におけるsiRNAを用いたRNAiの誘導」
      日本遺伝学会第79回大会(2007.9) 岡山大学理学部・創立50周年記念館(津島キャンパス)
    • 内藤 雄樹、納冨 香子、小野木 利成、程 久美子、西郷 薫、武部 豊
      「高いゲノム多様性をもつウイルスに効果的なsiRNAの設計とその検証」
      東京大学生命科学研究ネットワークシンポジウム2007「生命科学・知の構造化」(2007.9) 東京大学安田講堂/工学部2号館
    • 西 賢二、程 久美子、西郷 薫
      「新規エンドサイトーシスによる単純ヘルペスウイルス1型VP-22のC末端ドメインとGFP融合タンパク質の細胞内取り込み機構」
      東京大学生命科学研究ネットワークシンポジウム2007「生命科学・知の構造化」(2007.9) 東京大学安田講堂/工学部2号館
    • 内藤 雄樹、納冨 香子、小野木 利成、西郷 薫、武部 豊、程 久美子
      「哺乳類細胞で有効かつ標的遺伝子に特異的なsiRNA設計法の確立とその抗ウイルスRNA干渉法への応用」
      RNA研究若手の会2007(2007.9) ニチイ学館神戸ポートアイランドセンター
    • 程 久美子
      「網羅的RNA干渉法による機能ゲノム解析の基盤技術開発」
      バイオ医療オミックス情報学人材養成プログラム システム病態学2(2007.7) 東京医科歯科大学
    • 程 久美子
      「RNA科学の基礎から応用へ」
      日本バイオインフォマテイクス学会 第1回JSBi合同研究会(2007.5) 東京大学医科学研究所
    • 程 久美子
      「生命の神秘にせまるRNA」
      第11回東京大学理学部公開講演会「挑戦する理学〜自然の謎に迫る〜」(2007.4) 東京大学 駒場キャンパス 数理科学研究棟大講義室
    • Kumiko Ui-Tei and Kaoru Saigo
      ”The current infrastructure and activities of RNAi research in Japan”
      NRPGM/A-IMBN Workshop on Genome-Wide Approaches in Genomic Medicine(2007.1) Academia Sinica, Taipei, Taiwan